はじめに

paplot はゲノム解析結果を自動でグラフ化するツールです。

paplot は皆さんのゲノム解析を少しだけ楽にする…かもしれません。

作成できるレポートの種類

1. Quality Control (QC) レポート

アライメント率やカバレッジ率など、シーケンスデータの品質を表示します。

2. Chromosomal Aberration (CA) レポート

構造異常や融合遺伝子など、染色体間の変異を円形のプロットで可視化し、棒グラフでその分布を表示します。

3. Mutation Matrix レポート

検出した変異について縦軸を遺伝子 (Gene)、横軸をサンプル (Sample) として、変異タイプ別に表示します。

4. Mutational Signature レポート

検出した変異についての特徴的なパターン (変異シグネチャ) を表示します。

pmsignature を使用した表現も可能です。